Lấy đề tài kinh dị – học đường, Eko Eko Azarak xoay quanh Misa, một nữ sinh nổi tiếng và là “thần tượng” gương mẫu của biết bao bạn học cùng trường. Thế nhưng ẩn đằng sau hình mẫu hoàn hảo đó không ai biết Misa chính là một phù thủy. Ả ta chuyên đi từ trường này sang trường khác gieo rắc ma thuật đen tối, mang đến hỗn loạn và tàn bạo. Ngoài ra, truyện còn tập trung kể về quá khứ bí ẩn của Misa.